BigWig-ը ֆայլի ձևաչափ է՝ խիտ, շարունակական տվյալների ցուցադրման համար գենոմի բրաուզերի ուղու -ում, որը ստեղծվել է Wiggle (WIG) ձևաչափից փոխակերպմամբ: BigWig ձևաչափը նկարագրված է UCSC Genome Bioinformatics կայքում, և Broad Institute ֆայլի ձևաչափի ուղեցույցը լրացուցիչ տեղեկատվություն է տրամադրում:
Ի՞նչ է bigWig ձևաչափը:
BigWig ձևաչափը է խիտ, շարունակական տվյալների ցուցադրման համար, որոնք կցուցադրվեն որպես գրաֆիկ BigWig ֆայլերը սկզբնապես ստեղծվում են WIG տեսակի ֆայլերից՝ օգտագործելով UCSC wigToBigWig ծրագիրը: Որպես այլընտրանք, bigWig ֆայլերը կարող են ստեղծվել bedGraph ֆայլերից՝ օգտագործելով UCSC ծրագրի bedGraphToBigWig:
Ինչպե՞ս կարող եմ օգտագործել bigWig ֆայլը:
Տեղափոխեք նորաստեղծ bigWig ֆայլը (myBigWig.bw) դեպի վեբ հասանելի http, https կամ ftp տեղադրություն: Տեղադրեք URL-ը մաքսային ուղու մուտքագրման ձևի մեջ կամ կառուցեք հատուկ հետագիծ՝ օգտագործելով մեկ հետագծային գիծ: Տեղադրեք հատուկ հետագծային գիծը տեքստային վանդակում հատուկ հետագծերի կառավարման էջում:
Ի՞նչ է bigWig-ը:
bigWig Tracks-ը հետքեր են ամբողջ գենոմում շարունակական ազդանշանների համար: Դրանք հարմար են տարբեր «հում» փորձի արդյունքներ ցուցադրելու համար, ինչպիսիք են ChIP-Seq ազդանշանները, RNA-Seq ազդանշանները և այլն:
Ինչպե՞ս ստեղծել bigWig ֆայլ:
Կան մեծ ֆայլեր ստեղծելու բազմաթիվ եղանակներ: Սա սովորաբար ներառում է ա. bam ֆայլը wiggle track (. wig) և այնուհետև փոխակերպելով wiggle track-ը երկուական bigwig-ի (.
