Բոլոր ամինաթթուները հայտնաբերված են α-պարույրներում, սակայն գլիցինը և պրոլինը հազվադեպ են, քանի որ դրանք ապակայունացնում են α-պարույրը: Գլիցինը զերծ է բազմաթիվ ստերիկ սահմանափակումներից քանի որ չունի β ածխածին: … Պրոլինը, մյուս կողմից, չափազանց կոշտ է:
Ո՞ր ամինաթթուն չի հայտնաբերվել ալֆա պարույրներում:
Պրոլին չի հայտնաբերվում սպիտակուցների ալֆա պարուրաձև կառուցվածքում, քանի որ այն ունի հատուկ ցիկլային կառուցվածք (այն ամինո թթու է, ոչ թե ամինաթթու) և ունի այս տեսակի երկրորդական կառուցվածքը: կոնկրետ լայնություն և ամինաթթուների մնացորդների որոշակի քանակ / հերթ. Հետևաբար պրոլինը համարվում է ալֆա պարուրաձև անջատիչ։
Ինչու է գլիցինը ալֆա խխունջ անջատող:
Պրոլինը և գլիցինը երբեմն հայտնի են որպես «խխունջ անջատիչներ» քանի որ դրանք խախտում են α պարուրաձև ողնաշարի կառուցվածքի կանոնավորությունը; սակայն, երկուսն էլ ունեն անսովոր կոնֆորմացիոն ունակություններ և սովորաբար հանդիպում են հերթափոխով:
Որտե՞ղ է գլիկինը ալֆա պարույրում:
Խխունջ-շրջադարձ-խխունջ մոտիվում կան երեք դիրքեր, որոնք խիստ պահպանված են: Ալանինը սովորաբար հայտնաբերվում է առաջին α պարույրի 5-րդ դիրքում; գլիկին է հայտնաբերվել դիրքում 9՝ շրջադարձի առաջին դիրքում; և կամ վալինը կամ իզոլեյցինը սովորաբար հայտնաբերվում են 15-րդ դիրքում երկրորդ α պարույրի մեջ:
Արդյո՞ք գլիցինի մնացորդները գերակշռում են ալֆա պարույրներում:
Գլիցինը, իր բազմաթիվ հնարավոր հիմնական շղթայական կոնֆորմացիաներով, նույնպես հազվադեպ է հայտնաբերվել պարույրներում: Իմանալով, թե որքան հավանական է ամինաթթու առաջանալ ալֆա պարույրում (այսպես կոչված պարույրի հակումներ), հնարավոր է կանխատեսել, թե որտեղ են առաջանում պարույրները սպիտակուցային հաջորդականությամբ: