Մետագենոմիկան սահմանվում է որպես գենոմների ուղղակի գենետիկական վերլուծություն, որը պարունակվում է շրջակա միջավայրի նմուշով Ոլորտը սկզբում սկսվել է շրջակա միջավայրի ԴՆԹ-ի կլոնավորմամբ, որին հաջորդել է ֆունկցիոնալ էքսպրեսիայի սկրինինգը [1], և այնուհետև արագորեն լրացվեց շրջակա միջավայրի ԴՆԹ-ի ուղղակի պատահական որսորդական հրացանի հաջորդականությամբ [2, 3]:
Ի՞նչ է մետագենոմիկայի գործընթացը:
Մետագենոմիկա ներառում է ԴՆԹ-ի ստացում համայնքի բոլոր միկրոօրգանիզմներից՝ առանց պարտադիր կերպով նույնականացնելու ներգրավված բոլոր տեսակները: Այն բանից հետո, երբ գեները հաջորդականացվեն և համեմատվեն նույնականացված հաջորդականությունների հետ, կարելի է որոշել այդ գեների գործառույթները:
Ի՞նչ տեխնիկա է օգտագործվում մետագենոմիկայի մեջ:
Մանրէաբանական համայնքի նմուշը հավաքվում է ծովի ջրից, նստվածքից, հյուրընկալող կենդանիներից կամ այլ ծովային միջավայրից:Այնուհետև հավաքված բջիջները լիզվում են և ԴՆԹ-ն արդյունահանվում է դրանց լիզատից: Մետագենոմիկան հնարավոր դարձնելու տեխնիկան հրացանների հաջորդականացումն է, որը հաջորդականացնում է ԴՆԹ-ի պատահական հատվածները ոչ նպատակային ձևով:
Որո՞նք են մետագենոմիկայի ուսումնասիրության 3 քայլերը:
Մետագենոմիկայի քայլեր և գործընթացը
- Նմուշների հավաքածու՝
- ԴՆԹ արդյունահանում:
- Նմուշի պատրաստում.
- Նմուշի վերլուծություն.
Ինչպե՞ս է իրականացվում ֆունկցիոնալ մետագենոմիկան:
Ֆունկցիոնալ մետագենոմիկան ներառում է ԴՆԹ-ի մեկուսացում մանրէաբանական համայնքներից՝ ուսումնասիրելու կոդավորված սպիտակուցների գործառույթները: Այն ներառում է ԴՆԹ-ի բեկորների կլոնավորում, փոխնակ հյուրընկալողում գեների արտահայտում և ֆերմենտային գործունեության սքրինինգ:
