Բազմաթիվ հաջորդականության հավասարեցումները տրամադրում են ավելի շատ տեղեկատվություն, քան զույգ-զույգ հավասարեցումները, քանի որ դրանք ցույց են տալիս պահպանված տարածքները սպիտակուցային ընտանիքում, որոնք ունեն կառուցվածքային և ֆունկցիոնալ նշանակություն:
Ո՞րն է բազմակի հաջորդականության հավասարեցման նպատակը:
Հաշվի առնելով կենսաբանական հաջորդականությունների մի շարք (ՌՆԹ, սպիտակուցներ, ԴՆԹ), MSA մեթոդի նպատակն է հավասարեցնել հաջորդականությունները այնպես, որ արտացոլեն դրանց էվոլյուցիոն, ֆունկցիոնալ կամ կառուցվածքային հարաբերությունները(Նկար 1).
Ինչպե՞ս է բազմակի հաջորդականության հավասարեցումն օգնում էվոլյուցիայում:
Հավասարեցված հաջորդականություններն օգտագործվում են բազմաթիվ նպատակներով, այդ թվում՝ տարբերման օրինաչափությունների գնահատում, ընտրություն, էվոլյուցիոն փոփոխության տեմպ և եղանակ, ֆունկցիոնալ տարրերի և սահմանափակումների նույնականացում և ֆիլոգենետիկ պատմություն:, ընդամենը մի քանիսը նշելու համար։
Արդյո՞ք բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:
Բազմաթիվ հաջորդականության հավասարեցում (MSA) ը սովորաբար նույն երկարությամբ երեք կամ ավելի կենսաբանական հաջորդականությունների (սպիտակուցներ կամ նուկլեինաթթու) հավասարեցումն է Արդյունքից կարելի է եզրակացնել հոմոլոգիան և ուսումնասիրված հաջորդականությունների միջև էվոլյուցիոն հարաբերությունները: … Շատ արագ MSA գործիք, որը կենտրոնանում է տեղական շրջանների վրա:
Ինչպե՞ս է ստեղծվում բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:
Clustal Omega ալգորիթմը արտադրում է բազմակի հաջորդականության հավասարեցում առաջին հերթին ստեղծելով զույգական հավասարեցումներ k-tuple մեթոդով Այնուհետև հաջորդականությունները հավաքվում են mBed մեթոդի միջոցով: Դրան հաջորդում է k-means կլաստերավորման մեթոդը։ Ուղղորդող ծառը հաջորդիվ կառուցվում է UPGMA մեթոդով:
