Logo hy.boatexistence.com

Ինչու՞ բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:

Բովանդակություն:

Ինչու՞ բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:
Ինչու՞ բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:

Video: Ինչու՞ բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:

Video: Ինչու՞ բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:
Video: Ծրագրավորման որ ուղղությունն ընտրել։ UI/UX, FrontEnd, BackEnd, թե՞ FullStack ծրագրավորում։ 2024, Հուլիսի
Anonim

Բազմաթիվ հաջորդականության հավասարեցումները տրամադրում են ավելի շատ տեղեկատվություն, քան զույգ-զույգ հավասարեցումները, քանի որ դրանք ցույց են տալիս պահպանված տարածքները սպիտակուցային ընտանիքում, որոնք ունեն կառուցվածքային և ֆունկցիոնալ նշանակություն:

Ո՞րն է բազմակի հաջորդականության հավասարեցման նպատակը:

Հաշվի առնելով կենսաբանական հաջորդականությունների մի շարք (ՌՆԹ, սպիտակուցներ, ԴՆԹ), MSA մեթոդի նպատակն է հավասարեցնել հաջորդականությունները այնպես, որ արտացոլեն դրանց էվոլյուցիոն, ֆունկցիոնալ կամ կառուցվածքային հարաբերությունները(Նկար 1).

Ինչպե՞ս է բազմակի հաջորդականության հավասարեցումն օգնում էվոլյուցիայում:

Հավասարեցված հաջորդականություններն օգտագործվում են բազմաթիվ նպատակներով, այդ թվում՝ տարբերման օրինաչափությունների գնահատում, ընտրություն, էվոլյուցիոն փոփոխության տեմպ և եղանակ, ֆունկցիոնալ տարրերի և սահմանափակումների նույնականացում և ֆիլոգենետիկ պատմություն:, ընդամենը մի քանիսը նշելու համար։

Արդյո՞ք բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:

Բազմաթիվ հաջորդականության հավասարեցում (MSA) ը սովորաբար նույն երկարությամբ երեք կամ ավելի կենսաբանական հաջորդականությունների (սպիտակուցներ կամ նուկլեինաթթու) հավասարեցումն է Արդյունքից կարելի է եզրակացնել հոմոլոգիան և ուսումնասիրված հաջորդականությունների միջև էվոլյուցիոն հարաբերությունները: … Շատ արագ MSA գործիք, որը կենտրոնանում է տեղական շրջանների վրա:

Ինչպե՞ս է ստեղծվում բազմակի հաջորդականության հավասարեցում:

Clustal Omega ալգորիթմը արտադրում է բազմակի հաջորդականության հավասարեցում առաջին հերթին ստեղծելով զույգական հավասարեցումներ k-tuple մեթոդով Այնուհետև հաջորդականությունները հավաքվում են mBed մեթոդի միջոցով: Դրան հաջորդում է k-means կլաստերավորման մեթոդը։ Ուղղորդող ծառը հաջորդիվ կառուցվում է UPGMA մեթոդով:

Խորհուրդ ենք տալիս: