BLAST-ը համակարգչային ալգորիթմ է, որը հասանելի է առցանց օգտագործման համար Կենսատեխնոլոգիայի տեղեկատվության ազգային կենտրոնի (NCBI) կայքում, ինչպես նաև բազմաթիվ այլ կայքերում: BLAST-ը կարող է արագորեն հավասարեցնել և համեմատել հարցումների ԴՆԹ-ի հաջորդականությունը հաջորդականությունների տվյալների բազայի հետ, ինչը այն դարձնում է կարևոր գործիք ընթացիկ գենոմային հետազոտություններում:
Արդյո՞ք BLAST-ը առաջնային տվյալների բազա է:
BLAST-ը կենսաինֆորմատիկայի հետազոտության մեջ ամենաշատ օգտագործվող ծրագրաշարն է: Դրա հիմնական գործառույթն է համեմատել հետաքրքրության հաջորդականությունը, հարցումների հաջորդականությունը, մեծ տվյալների բազայիBLAST-ի հաջորդականությունների հետ, այնուհետև հայտնում է տվյալների բազայում հայտնաբերված լավագույն համընկնումները կամ «հիթերը»: Այս պարզ ծրագիրն ունի երկու հիմնական հավելված:
Արդյո՞ք NCBI-ն տվյալների բազա է:
NCBI-ն ունի մի շարք տվյալների շտեմարաններ, որոնք վերաբերում են կենսատեխնոլոգիային և կենսաբժշկությանը և հանդիսանում է կենսաինֆորմատիկայի գործիքների և ծառայությունների կարևոր ռեսուրս:Հիմնական տվյալների բազաները ներառում են GenBank-ը ԴՆԹ-ի հաջորդականությունների համար և PubMed-ը՝ կենսաբժշկական գրականության մատենագիտական տվյալների բազան: Այլ տվյալների բազաները ներառում են NCBI Epigenomics տվյալների բազան:
Արդյո՞ք BLAST-ն օգտագործվում է միայն NCBI տվյալների բազայում:
BLAST-ը հասանելի է համացանցում՝ NCBI կայքում: BLAST-ների տարբեր տեսակներ հասանելի են՝ ըստ հարցումների հաջորդականության և թիրախային տվյալների բազաների:
Ինչպե՞ս է աշխատում BLAST տվյալների բազան:
Ինչպե՞ս է աշխատում BLAST-ը: BLAST-ը նույնացնում է հոմոլոգ հաջորդականությունը՝ օգտագործելով էվրիստիկ մեթոդը, որն ի սկզբանե գտնում է կարճ համընկնումներ երկու հաջորդականությունների միջև; Այսպիսով, մեթոդը հաշվի չի առնում ամբողջ հաջորդական տարածքը: Սկզբնական համընկնումից հետո BLAST-ը փորձում է սկսել լոկալ հավասարեցումներն այս սկզբնական համընկնումներից:
